جرمی آیرونز نقش یک یسوعی اسپانیایی را بازی می‌کند که به دل جنگل‌های آمریکای جنوبی می‌رود تا یک میسیون بسازد با امید اینکه بومیان منطقه را مسیحی کند. رابرت دنیرو نقش یک شکارچی برده را بازی می‌کند که تبدیل به مسیحی می‌شود و به یسوعی در میسیونش ملحق می‌شود. وقتی اسپانیا مستعمره را به پرتغال می‌فروشد، آنها مجبور می‌شوند از تمام آنچه ساخته‌اند در برابر مهاجمان پرتغالی دفاع کنند.